ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ДЛЯ ОЦЕНКИ СОСТОЯНИЯ РЕЛИКТОВЫХ ВИДОВ РАСТЕНИЙ БАЙКАЛЬСКОЙ СИБИРИ
- Авторы: Протопопова МВ1, Павличенко ВВ1, Гнутиков АА2,3, Адельшин РВ4, Чепинога ВВ5,6
-
Учреждения:
- Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН (СИФИБР СО РАН)
- Ботанический институт им. В.Л. Комарова Российской академии наук (БИН РАН)
- Всероссийский институт генетических ресурсов растений им. Н.И. Вавилова (ВИР РАН)
- Научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока Роспотребнадзора
- Институт географии им. В.Б. Сочавы СО РАН (ИГ СО РАН)
- Иркутский государственный университет (ФГБОУ ВПО «ИГУ»)
- Выпуск: № 4 (2015)
- Страницы: 28-36
- Раздел: Статьи
- URL: https://journals.rudn.ru/ecology/article/view/12867
Цитировать
Полный текст
Аннотация
Наличие реликтовых видов в составе флоры Байкальской Сибири обуславливает необходимость разработки эффективных методов мониторинга состояния природных объектов этого региона. Данная работа направленна на поиск молекулярных маркеров, эффективно отражающих степень генетического полиморфизма популяций модельных видов растений для их возможного применения в оценке состояния реликтового комплекса Байкальской Сибири. В работе представлены данные о возможном использовании некоторых генетических маркеров (ITS1, ITS2, rps12-rpl20, psbA-trnH) для оценки состояния двух реликтовых видов растений Anemone baicalensis Turcz. и Eranthis sibirica DC.
Об авторах
М В Протопопова
Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН (СИФИБР СО РАН)
В В Павличенко
Сибирский институт физиологии и биохимии растений СО РАН (СИФИБР СО РАН)
А А Гнутиков
Ботанический институт им. В.Л. Комарова Российской академии наук (БИН РАН); Всероссийский институт генетических ресурсов растений им. Н.И. Вавилова (ВИР РАН)
Р В Адельшин
Научно-исследовательский противочумный институт Сибири и Дальнего Востока Роспотребнадзора
В В Чепинога
Институт географии им. В.Б. Сочавы СО РАН (ИГ СО РАН); Иркутский государственный университет (ФГБОУ ВПО «ИГУ»)Биолого-почвенный факультет
Список литературы
- Малышев Л.И., Пешкова Г.А. Особенности и генезис флоры Сибири: Предбайкалье и Забайкалье. Новосибирск: Наука, 1984.
- Положий А.В., Крапивкина Э.Д. Реликты третичных широколиственных лесов во флоре Сибири. Томск: Изд-во Томск. ун-та, 1985.
- Чепинога В.В. Хромосомные числа растений флоры Байкальской Сибири. Новосибирск: Наука, 2014.
- Avise, J.C. Phylogeography: The History and Formation of Species. Cambridge: Harvard University Press, 2000.
- Avise, J.C. Molecular Markers, Natural History, and Evolution (Second Edition). Sunderland: Sinauer, 2004.
- Chen T., Wang X., Tang H., Chen Q., Huang X., Chen J. Genetic diversity and population structure of Chinese Cherry revealed by chloroplast DNA trnQ-rps16 intergenic spacers variation // Genet. Resour. Crop Evol. 2013. Vol. 60. P. 1859-1871.
- Doyle J.J., Doyle J.L. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue // Phytochem. Bull. 1987. Vol. 19. P. 11-15.
- Feng X., Wang Y., Gang X. Genetic diversity, genetic structure and demographic history of Cycas simplicipinna (Cycadaceae) assessed by DNA sequences and SSR markers // BMC Plant Biology. 2014. Vol. 14. № 187. 1-16.
- Furlan E., Stoklosa J., Griffiths J., Gust N., Ellis R., Huggins R.M., Weeks A.R. Small population size and extremely low levels of genetic diversity in island populations of the platypus Ornithorhynchus anatinus // Ecol. Evol. 2012. Vol. 2. № 4. P. 844-857.
- Hamilton M. Four primer pairs for the amplification of chloroplast intergenic regions with intraspecific variation // Molecular Ecology. 1999. Vol. 8. P. 521-52.
- Hoffmann A.A., Willi Y. Detecting genetic responses to enviromental change // Natural Revievs Genetics. 2008. Vol. 9. № 6. P. 421-432.
- Nei M., Kumar S. Molecular Evolution and Phylogenetics. New York: Oxford University Press, 2000.
- Tamura K., Nei M., Kumar S. Prospects for inferring very large phylogenies by using the neighbor-joining method // Proceedings of the National Academy of Sciences. 2004. Vol. 101. P. 11030-11035.
- Utelli A., Roy B., Baltisberger M. Molecular and morphological analyses of European Aconitum species (Ranunculaceae) // Plant Systematics and Evolution. 2000. V. 224. P. 195-212.
- Wang L., Abbott R. J., Zheng W., Chen P., Wang Y., Liu J. History and evolution of alpine plants endemic to the Qinghai-Tibetan Plateau: Aconitum gymnandrum (Ranunculaceae) // Molecular Ecology. 2009. Vol. 18. № 4. P. 709-21.
- Wang W., Zinam S.N., Dutton B.E. Anemone Linnaeus // Flora of China. 2001. Vol. 6. P. 307-328.
- Wilson R.C.L., Drury S.A., Chapman J.L. The Great Ice Age: climate change and life. London: Routledge and the Open University, 2000.