Аннотация
Рассматривается проблема существенного сжатия данных, подлежащих вводу в классифицирующую нейронную сеть, без потери их информативности. Изложение ведется на примере задачи генетического анализа белковых структур, важной для исследований в генетической биологии, радиобиологии и особенно в сельском хозяйстве. Подобный анализ обычно проводится с помощью изучения электрофоретических спектров (ЭФС) глиадинов (спирторастворимых белков) проверяемых сортов зерновых. При оцифровке ЭФС получается денситограмма из 4000 отсчётов, наиболее информативные признаки которой и должны быть выделены для ввода в нейросеть. Кроме того, полученные данные требуют существенной предобработки для сглаживания и устранения подложки денситограммы, а также таких дефектов процесса оцифровки, как шумы, флюктуации границ и освещённости спектров и их нелинейных растяжений из-за нестационарности электрофореза.
Было изучено несколько альтернативных методов извлечения существенных признаков: (1) огрубление денситограммы до 200 усреднённых измерений; (2) метод главных компонент; (3) распознавание хорошо различимых пиков, чтобы вводить в нейросеть только их параметры; (4)-(5) сжатие данных с помощью быстрого преобразования Фурье (БПФ) и дискретного вейвлет-преобразования (ДВП). Эти методы использовались для извлечения главных признаков из множества выборок, приготовленных экспертами для 30 разных сортов, и последующего использования признаков для обучения трёхслойного персептрона. Сравнительный анализ эффективности распознавания при использовании вышеперечисленных методов показал их сильную зависимость от числа сортов, подлежащих классификации. Лишь с помощью БПФ и ДВП методов удалось удержать эффективность на уровне 95-97% вплоть до 20 сортов.
Предполагается дальнейшее развитие методов сжатия данных и возможности использовать систему многоступенчатых нейроклассификаторов.
Отправить статью по E-mail 
