<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Discrete and Continuous Models and Applied Computational Science</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Discrete and Continuous Models and Applied Computational Science</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Discrete and Continuous Models and Applied Computational Science</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2658-4670</issn><issn publication-format="electronic">2658-7149</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Peoples' Friendship University of Russia named after Patrice Lumumba (RUDN University)</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">8615</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Procedure for Constructing Simplectic Numerical Schemes for Solving of Hamiltonian Systems of Equations</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Процедура построения симплектических численных схем для решения гамильтоновых систем уравнений</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Batgerel</surname><given-names>B</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Батгэрэл</surname><given-names>Балт</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en">Laboratory of Information Technologies; The Mongolian University of Science and Technology 8th khoroo, Baga toiruu 34, Sukhbaatar district Ulaanbaatar, Mongolia, 14191</bio><bio xml:lang="ru">Лаборатория информационных технологий; Монгольский государственный университет науки и технологии Улан-Батор, Монголия</bio><email>batgerel@jinr.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Nikonov</surname><given-names>E G</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Никонов</surname><given-names>Эдуард Германович</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en">Laboratory of Information Technologies</bio><bio xml:lang="ru">Лаборатория информационных технологий</bio><email>e.nikonov@jinr.r</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Puzynin</surname><given-names>I V</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Пузынин</surname><given-names>Игорь Викторович</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="en">Laboratory of Information Technologies</bio><bio xml:lang="ru">Лаборатория информационных технологий</bio><email>ipuzynin@jinr.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Joint Institute for Nuclear Research</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Объединённый институт ядерных исследований</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2016-01-15" publication-format="electronic"><day>15</day><month>01</month><year>2016</year></pub-date><issue>1</issue><issue-title xml:lang="en">NO1 (2016)</issue-title><issue-title xml:lang="ru">№1 (2016)</issue-title><fpage>41</fpage><lpage>58</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2016-09-08"><day>08</day><month>09</month><year>2016</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2016, Батгэрэл Б., Никонов Э.Г., Пузынин И.В.</copyright-statement><copyright-year>2016</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Батгэрэл Б., Никонов Э.Г., Пузынин И.В.</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">http://creativecommons.org/licenses/by/4.0</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://journals.rudn.ru/miph/article/view/8615">https://journals.rudn.ru/miph/article/view/8615</self-uri><abstract xml:lang="en">Numerical schemes which is used for solving of many-particle dynamics systems of equations can have restrictions on a step and an interval of integration because if its increase the numerical schemes became unstable and don’t conserve existing integrals of motion. As a result when we simulate many-particle system behavior on the suﬃciently large time interval we should decrease an integration step which leads to considerableincreasing of computation quantity. In this paper a new procedure for constructing simplectic numerical schemes for solving of Hamiltonian systems of equations is proposed. A method for symmetrization of received simplectics numerical schemes is proposed too. Constructed by proposed in the paper procedure numerical schemes conserve energy of a system on the large interval of numerical integration for relatively large integration step incomparison with Verlet method which is usually used for solving of equations of motion in molecular dynamics. Results of numerical experiments are given in the paper. These results show main advantages of received symmetric simplectic numerical schemes of third order of accuracy for the integration step for the Hamiltonian systems of equations in comparison with numerical schemes of Verlet method of second order of accuracy.</abstract><trans-abstract xml:lang="ru">Применяемые в настоящее время схемы численного решения систем уравнений динамики многих частиц могут иметь ограничения по шагу и интервалу интегрирования, поскольку при их увеличении численные схемы становятся неустойчивыми и не сохраняют существующие интегралы движения. В результате при моделировании поведения системы частиц на достаточно больших интервалах времени приходится уменьшать шаг интегрирования, что приводит к существенному увеличению объёма вычислений. В работе предложена новая процедура построения симплектических численных схем для решения гамильтоновых систем уравнений. Предложен подход к симметризации полученных симплектических разностных схем. Численные схемы, построенные при помощи предложенной в работе процедуры, сохраняют энергию системы на большом интервале численного интегрирования при относительно больших величинах шага интегрирования по сравнению с методом Верле, который обычно используется при решении уравнений движения молекулярной динамики. Приведены результаты численных экспериментов, демонстрирующие основные преимущества полученных в работе симметричных симплектических численных схем третьего порядка точности по шагу интегрирования гамильтоновых систем уравнений по сравнению с численными схемами метода Верле второго порядка.</trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>Hamiltonian systems of equations</kwd><kwd>simplectic diﬀerence schemes</kwd><kwd>generating functions</kwd><kwd>molecular dynamics</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>гамильтоновы системы уравнений</kwd><kwd>симплектические разностные схемы</kwd><kwd>производящие функции</kwd><kwd>молекулярная динамика</kwd></kwd-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Hairer E., Lubich C., Wanner G. Geometric Numerical Integration. - Berlin, Heidelberg: Springer, 2006. - P. 644.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Методы молекулярной динамики для моделирования физических и биологических процессов / Х. Т. Холмуродов, М. В. Алтайский, И. В. Пузынин и др. // Физика элементарных частиц и атомного ядра. - 2003. - Т. 34, № 2. - С. 472-515.</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>MDGRAPE-4: a Special-Purpose Computer System for Molecular Dynamics Simulations / I. Ohmura, G. Morimoto, Y. Ohno et al. // Philos Trans A Math Phys Eng Sci. - 2014. - Vol. 372, No 2021. - Pp. 1-16.</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Akishin P. G., Puzynin I. V., Vinitsky S. I. A Hybrid Numerical Method for Analysis of Dynamics of the Classical Hamiltonian Systems // Comp. Math. Applic. - 1997. - Vol. 34, No 2-4. - Pp. 45-73.</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Las Palmeras Molecular Dynamics: Flexible and modular molecular dynamics / S. Davis, C. Loyola, F. Gonzalez, J. Peralta // Computer Physics Communications. - 2010. - Vol. 181, No 12. - Pp. 2126-2139.</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Гантмахер Ф. Р. Лекции по аналитической механике. - М.: Физматлит, 2001. - С. 262.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
