Discrete and Continuous Models and Applied Computational ScienceDiscrete and Continuous Models and Applied Computational ScienceDiscrete and Continuous Models and Applied Computational Science2658-46702658-7149Peoples' Friendship University of Russia named after Patrice Lumumba (RUDN University)8218ArticlesСтатьиResearch ArticleResearch of Acceleration Calculations in Solving Scientific Problems on the Heterogeneous Cluster HybriLITИсследование ускорения вычислений при решении научных задач на гетерогенном кластере HybriLITAlexandrovE IАлександровЕвгений ИгоревичLaboratory of Information TechnologiesЛаборатория информационных технологийaleksand@jinr.ruBelyakovD VБеляковДмитрий ВикторовичLaboratory of Information TechnologiesЛаборатория информационных технологийdmitry@jinr.ruMatveyevM AМатвеевМихаил АлександровичLaboratory of Information TechnologiesЛаборатория информационных технологийmatveevma@jinr.ruPodgainyD VПодгайныйДмитрий ВладимировичLaboratory of Information TechnologiesЛаборатория информационных технологийpodgainy@jinr.ruStreltsovaO IСтрельцоваОксана ИвановнаLaboratory of Information TechnologiesЛаборатория информационных технологийstrel@jinr.ruTorosyanSh GТоросянШушаник ГрачевнаLaboratory of Information TechnologiesЛаборатория информационных технологийshushanik@jinr.ruZemlyanayaE VЗемлянаяЕлена ВалерьевнаLaboratory of Information TechnologiesЛаборатория информационных технологийelena@jinr.ruZrelovP VЗреловПетр ВалентиновичLaboratory of Information Technologies; Plekhanov Russian University of Economics 36, Stremyanny per., Moscow, Russia, 117997Лаборатория информационных технологий; Российский экономический университет имени Г.В. Плеханова Стремянный пер., д. 36, Москва, Россия, 117997zrelov@jinr.ruZuevM IЗуевМаксим ИгоревичLaboratory of Information TechnologiesЛаборатория информационных технологийzuevmax@jinr.ruJoint Institute for Nuclear ResearchОбъединённый институт ядерных исследований150420154NO4 (2015)№4 (2015)303708092016Copyright ©; 2015, Александров Е.И., Беляков Д.В., Матвеев М.А., Подгайный Д.В., Стрельцова О.И., Торосян Ш.Г., Земляная Е.В., Зрелов П.В., Зуев М.И.2015Александров Е.И., Беляков Д.В., Матвеев М.А., Подгайный Д.В., Стрельцова О.И., Торосян Ш.Г., Земляная Е.В., Зрелов П.В., Зуев М.И.http://creativecommons.org/licenses/by/4.0https://journals.rudn.ru/miph/article/view/8218The paper presents some test results of the heterogeneous computing cluster HybriLIT put into operation at the Laboratory information technologies of the Joint Institute for Nuclear Research. The structure of the cluster includes computational nodes with NVIDIA graphical accelerators and Intel Xeon Phi coprocessors. The necessity of integration of such a computational platform in the JINR Multifunctional Information and Computing Complex is determined by a global tendency to use hybrid computing architectures for carrying out massive-parallel computations in applied scientific problems solution. Test of the cluster aimed at: first of all, test of the efficiency of hardware and software settings that include operational system, resource manager, file system, compilers, and, secondly, test of the efficiency of using different architectures for the solution of particular applied problems in order to provide user guides on specialized libraries. For realization of the cluster test, an approach that includes test computations by means of standard program packages such as Linpack and program complexes established in LIT has been developed. The presented results show that the use of hybrid computing architectures allow accelerate the solution of applied scientific problems, and heterogeneous computing cluster HybriLIT is an effective means of accomplishing this aim.В работе представлены некоторые результаты тестирования введенного в эксплуатацию в Лаборатории информационных технологий Объединенного института ядерных исследований гетерогенного вычислительного кластера HybriLIT. В состав кластера входят вычислительные узлы с графическими ускорителями NVIDIA и сопроцессорами Intel Xeon Phi. Необходимость введения такой вычислительной платформы в состав Многофункционального информационно-вычислительного центра ОИЯИ обусловлена мировой тенденцией применения гибридных вычислительных архитектур для проведения массивно-параллельных вычислений при решении научно-прикладных задач. Проводимое тестирование кластера преследовало две основных цели, а именно тестирование эффективности настройки аппаратной части и базового программного обеспечения, включающего в себя операционную систему, планировщик задач, файловую систему, компиляторы, а также исследование эффективности использования различных архитектур для решения конкретных прикладных задач с целью выработки рекомендаций пользователям по использованию специализированных библиотек. Для реализации тестирования кластера была разработана методика, включающая в себя тестовые расчеты как с использованием стандартных пакетов программ, таких как Linpack, так и программных комплексов созданных в ЛИТ. Из представленных в работе результатов следует, что использование гибридных вычислительных архитектур позволяет существенно ускорить решение научно-прикладных задач, а гетерогенный вычислительный кластер HybriLIT является эффективным средством для достижения этой цели.high performance platformLinpack benchmarkstechnology of parallel programmingheterogeneous computingLinpack benchmarksвысокопроизводительные вычислительные комплексытехнологии параллельного программированияпрограммные комплексыгетерогенные вычисления1.TOP500 Supercomputer Sites. - http://www.top500.org.2.NVIDIA Company. - http://www.nvidia.com/page/home.html.3.GPU Applications. High Performance Computing. - http://www.nvidia.com/object/gpu-applications.html.4.Heterogeneous computing cluster HybriLIT of LIT JINR. - http://hybrilit.jinr.ru.5.The job management systems SLURM: Simple Linux utility for resource management. - http://slurm.schedmd.com/.6.Network File System (NFS) version 4 Protocol. - https://www.ietf.org/rfc/rfc3530.txt.7.Intel Optimized LINPACK Benchmark and the Intel Optimized MP LINPACK Benchmark. - https://software.intel.com/en-us/articles/intel-math-kernel-library-linpack-download.8.Принципы построения программного комплекса для. моделирования физических процессов на гибридных. вычислительных системах (на примере комплекса GIMM_FPEIP) / Александров Е.И., Амирханов И.В., Земляная Е.В. и др. // Вестник РУДН. Серия «Математика. Информатика. Физика». 2014. № 2. С. 197-205.9.MCTDHB-lab software. - http://QDlab.org.10.MPI реализация алгоритмов для 2D и 3D моделирования. фазовых переходов в материалах, облучаемых тяжёлыми. ионами, в рамках модели термического пика / Амирханов И.В., Земляная Е.В., Саркар Н.Р. и др. // Вестник РУДН. Серия «Математика. Информатика. Физика». 2013. № 4. С. 80-94.