RUDN Journal of Ecology and Life SafetyRUDN Journal of Ecology and Life SafetyВестник Российского университета дружбы народов. Серия: Экология и безопасность жизнедеятельности2313-23102408-8919Peoples’ Friendship University of Russia named after Patrice Lumumba (RUDN University)2210710.22363/2313-2310-2019-27-1-29-38EcologyЭкологияResearch ArticleBiodiversity of microbial communities on some species in the class Gastropoda common in coastal waters in Central VietnamБиоразнообразие микробных сообществ некоторых видов класса Гастропода, распространенного в прибрежных водах в центральной части ВьетнамаChuThanh BinhТьуТхань Бинь

researcher of Laboratory of Microbiology, Institute of Biotechnology

научный сотрудник микробиологической лаборатории, Институт биотехнологии

chuthanhbinhvn@gmail.comDoThi Thu HongДоТхи Тху Хонг

researcher of Laboratory of Microbiology, Institute of Biotechnology

научный сотрудник микробиологической лаборатории

hongdt1009@gmail.comLeXuan ThinhЛеСуан Тхинь

chief technician of Stem Cell Bank

главный техник банка стволовых клеток

thinhhuyethoc@gmail.comNgoCao CuongНгоКао Кыонг

researcher of Laboratory of Microbiology

научный сотрудник микробиологической лаборатории, Институт биотехнологии

huyen.cnsh76@gmail.comPhamThi Thu HuyenФамТхи Тху Хуен

researcher of Laboratory of Microbiology

научный сотрудник микробиологической лаборатории, Институт биотехнологии

huyen.cnsh76@gmail.comHoangThi Thuy DuongХоангТхи Тхую Зыонг

chief of Laboratory of Aquatic Ecology

заведующий лабораторией экологии водной среды, Институт тропической экологии

httduong_ttndvn@hotmail.comNguyenTai TuНгуенТай Ту

researcher of Laboratory of Aquatic Ecology

научный сотрудник микробиологической лаборатории, Институт биотехнологии

taitu1990@gmail.comBritaevTemir AБритаевТемир Аланович

researcher

исследователь, Институт тропической экологии, Российсковьетнамский тропический научно-исследовательский и технологический центр; доктор биологических наук, профессор, приглашенный лектор биологического факультета Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова и биологического факультета Университета Модены и Реджо-Эмилии (Италия).

Britayev@yandex.ruVietnam - Russia Tropical CenterРоссийско-вьетнамский тропический научно-исследовательский и технологический центрNational Institute of Hematology and Blood TransfusionНациональный институт гематологии и переливания крови15122019271VOL 27, NO1 (2019)ТОМ 27, №1 (2019)293815112019Copyright ©; 2019, Chu T.B., Do T.H., Le X.T., Ngo C.C., Pham T.H., Hoang T.D., Nguyen T.T., Britaev T.A.Copyright ©; 2019, Тьу Т.Б., До Т.Х., Ле С.Т., Нго К.К., Фам Т.Х., Хоанг Т.З., Нгуен Т.Т., Бритаев Т.А.2019Chu T.B., Do T.H., Le X.T., Ngo C.C., Pham T.H., Hoang T.D., Nguyen T.T., Britaev T.A.Тьу Т.Б., До Т.Х., Ле С.Т., Нго К.К., Фам Т.Х., Хоанг Т.З., Нгуен Т.Т., Бритаев Т.А.https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0https://journals.rudn.ru/ecology/article/view/22107

Gastropoda is a large class in coastal waters in Central Vietnam. The interaction between microorganisms and Gastropoda mainly consists of symbiotic and parasitic relationships. In this study, biodiversity of microbial communities on some species of Gastropoda is evaluated, thereby predicting their interaction. From 12 samples of Gastropoda including 3 species: Trochus maculatus , Cypraea eglantica , Chicoreus bruneus , 101 microorganism strains including 79 bacterial strains (78.2%), 18 yeast strains (17.8%) and 4 actinomycetes strains (4.0%) were isolated. There were 15 strains (including 8 yeast strains, 5 bacterial strains and 2 actinomycetes strains) selected to identify based on sequence analysis of the D1/D2 region (yeast) and 16S rRNA gene (bacteria and actinomycetes). Based on the identification results, it is possible to predict the nutritional relationship between microorganisms and species of Gastropoda.

Гастропода - это большой класс моллюсков в прибрежных водах в центральной части Вьетнама. Взаимодействие между микроорганизмами и гастроподой в основном состоит из симбиотических и паразитических отношений. В настоящем исследовании оценивается биоразнообразие микробных сообществ некоторых видов гастроподы, что позволяет прогнозировать их взаимодействие. Из 12 образцов гастроподы, включающих 3 вида: Trochus maculatus , Cypraea eglantica , Chicoreus bruneus , изолирован 101 штамм микроорганизмов, из них 79 штаммов бактерий (78,2 %), 18 штаммов дрожжей (17,8 %) и 4 штамма актиномицетов (4,0 %). Было отобрано 15 штаммов (включая 8 штаммов дрожжей, 5 штаммов бактерий и 2 штамма актиномицетов) для идентификации на основе анализа последовательностей области D1/D2 (дрожжи) и гена 16S рРНК (бактерии и актиномицеты). На основании результатов идентификации можно предсказать питательную взаимосвязь между микроорганизмами и видами гастроподы.

GastropodabiodiversitymicroorganismsCentral Vietnamгастроподабиоразнообразиемикроорганизмыцентральная часть ВьетнамаThis research has been supported by Project E1.3 from The Scientific Committee of Vietnam – Russia Tropical Center.Исследование выполнено при поддержке Российско-вьетнамского тропического научно-исследовательского и технологического центра, проект E1.3.Dar MA, Pawar KD, Jadhav JP, Pandit RS. Isolation of cellulolytic bacteria from the gastrointestinal tract of Achatina fulica (Gastropoda: Pulmonata) and their evaluation for cellulose biodegradation. International Biodeterioration & Biodegradation. 2015; 98: 73–80.Dar M.A., Pawar K.D, Jadhav J.P., Pandit R.S. Isolation of cellulolytic bacteria from the gastrointestinal tract of Achatina fulica (Gastropoda: Pulmonata) and their evaluation for cellulose biodegradation // International Biodeterioration & Biodegradation. 2015. Vol. 98. Pp. 73–80.Dar MA, Pawar KD, Pandit RS. Gut Microbiome Analysis of Snails: A Biotechnological Approach. Organismal and Molecular Malacology, Sajal Ray, IntechOpen. 2017. doi: 10.5772/68133Dar M.A., Pawar K.D., Pandit R.S. Gut Microbiome Analysis of Snails: A Biotechnological Approach // Organismal and Molecular Malacology, Sajal Ray, IntechOpen. 2017. doi: 10.5772/68133Duarte AWF, Pagnocca F, Chaud L, Dayo-Owoyemi I, Pessoa A, Felipe MGA, Sette LD. Taxonomic assessment and enzymes production by yeasts isolated from marine and terrestrial Antarctic samples. Extremophiles: Microbial Life Under Extreme Conditions. 2013.Duarte A.W.F., Pagnocca F., Chaud L., Dayo-Owoyemi I., Pessoa A., Felipe M.G.A., Sette L.D. Taxonomic assessment and enzymes production by yeasts isolated from marine and terrestrial Antarctic samples // Extremophiles: Microbial Life Under Extreme Conditions. 2013.Eaton AD, Clesceri LS, Greenberg AW. (eds.) Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater. 21st Ed. Washington: APHA; 2005.Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater. 21st ed. / ed. byGuus R, Irene LG. On the evolutionary ecology of symbioses between chemosynthetic bacteria and bivalves. Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012;94: 1–10.Eaton, L.S. Clesceri, A.W. Greenberg. Washington: APHA, 2005.Greenberg AE, Trussell RR, Clesceri LS. (Eds). Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater. 16th/19th Ed. Washington: APHA; 1985.Guus R., Irene L.G. On the evolutionary ecology of symbioses between chemosynthetic bacteria and bivalves // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2012. Vol. 94. Pp. 1–10.Lutaenko KA, Kwang-Sik Choi, Thai NC. Coastal Marine Biodiversity of Vietnam: Regional and Local Challenges and Coastal Zone Management for Sustainable Development. Final Report submitted to APN. 2011.Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater. 16th/19th ed. / ed. byKurtzman CP, Fell JW, Boekhout T, Robert V. Methods for isolation, phenotypic characterization and maintenance of yeasts. In Kurtzman CP, Fell JW, Boekhout T. (eds.) The yeasts: a taxonomic study. 5th ed. San Diego: Elsevier; 2011. p. 88–110.Greenberg, R.R. Trussell, L.S. Clesceri. Washington: APHA, 1985.Kurtböke I. Microbial Resources: From Functional Existence in Nature to Applications. London: Academic Press; 2017.Lutaenko K.A., Kwang-Sik Choi, Thai N.C. Coastal Marine Biodiversity of Vietnam: Regional and Local Challenges and Coastal Zone Management for Sustainable Development. Final Report submitted to APN. 2011.Taylor JD, Glover EA. Chemosymbiotic bivalves. In: Landman NH, Jones DS. (eds.) The vent and seep biota. The Netherlands: Springer; 2010. p. 107–135.Kurtzman C.P., Fell J.W., Boekhout T., Robert V. Methods for isolation, phenotypic characterization and maintenance of yeasts // The yeasts: a taxonomic study. 5th ed. / ed. by C.P. Kurtzman, J.W. Fell, T. Boekhout. San Diego: Elsevier, 2011. Pp. 88–110.Kurtböke I. Microbial Resources: From Functional Existence in Nature to Applications. London: Academic Press, 2017.Taylor J.D., Glover E.A. Chemosymbiotic bivalves // The vent and seep biota / ed. by N.H. Landman, D.S. Jones. The Netherlands: Springer, 2010. Pp. 107–135.